基于ITS2条形码SNPs的人参和西洋参PCR SSCP分子鉴别研究(2)
1.6 DNA序列测定 PCR扩增产物由上海生工生物技术公司测序,在NCBI网站进行BLAST比对,并将所有样品测序结果采用DNAMAN软件进行序列比对,验证特异位点。2 结果
2.1 DNA提取 将提取纯化的人参和西洋参总DNA经琼脂糖凝胶分析,DNA降解较为严重,见图1。
2.2 引物 从GenBank上下载的人参和西洋参的ITS2序列,经DNAMAN调整后序列比对,人参和西洋参在第28碱基处和第39碱基出现C→T转换,将这2个位置定义为人参和西洋参的特异位点。由于PCR-SSCP分析的适宜长度为200 bp左右,因此采用Primer Premier 5.0软件设计出扩增产物包含特异位点的引物,上游引物SF 5′-CAGAATCCCGTGAACCA-3′,下游引物SR 5′-CCGCACGACATGAGAAG-3′,产物长度248 bp。
2.3 PCR扩增 人参和西洋参的样品R1~R11 ......
您现在查看是摘要页,全文长 3667 字符。